Coriolis μ空气采样器:医院环境空气中SARS-CoV-2病毒的采集检测方案
当前的Covid-19肺炎疫情已经暴露出我们的公共健康管理系统在面对未知病毒感染时的薄弱性。研究理解SARS-CoV-2病毒在空气中的传播途径会提高应对当前爆发的能力,以及对应防护措施和控制途径。本篇研究中报道了英国伦敦帝国理工学院在伦敦Covid-19疫情爆发高点时,使用表面咽拭子和Coriolis μ空气采样器,结合RT-PCR检测,对伦敦医院环境空气中和物品表面的SARS-CoV-2病毒进行了检测。
Coriolis空气采样器
>>Coriolis μ
Coriolis μ空气采样器流速可达300L/min,其可在几小时内收集空气样本来检测病毒,它采用专利的湿壁气旋采集技术,可将病毒直接采集到收集液中,采集的液体样本兼容下游所有的快速检测手段,如qPCR、NGS分析、流式等。
>>Coriolis Compact
Coriolis Compact空气采样器是最新推出的型号,它采用干壁气旋采集技术,可将空气中的生物样本如细菌、病毒、孢子、花粉等采集到收集瓶,之后用缓冲液重悬样本颗粒。其流速为50L/min,续航可达8小时。得到的样本兼容下游所有的快速检测手段,如PCR、NGS分析、流式等。
实验程序
>> 样本设计
伦敦Covid-19爆发高点(2020.4.2-2020.4.20),对伦敦西北部医院8个不同地点(包括7个病房区域和1个公共区域)取样。地点的列表如图1所示,所有取样的病房都住有确诊病人,且离急诊科较远。每个病房区域都收集4个空气样本(包括急诊科和公共区域)。物品表面的样品使用棉签在离收集空气样本25cm2的区域物品上擦拭收集。
>>空气采集
使用Coriolis μ空气采样器(法国Bertin),流速100L/min,收集时间为10分钟(约1m3的空气样本),收集液为5mlDMEM。
>>RT-PCR检测
RNA提取使用Qiagen病毒RNA提取试剂盒,样本量为140ul。使用AgPath One-step进行RT-PCR检测。
>>病毒培养
使用Vero E6和Caco2细胞系对环境空气中采集的病毒样本进行培养。
>>实验结果
如图1所示,为所有取样样本的PCR结果,其中在空气样本或物品表面样本均检测到SARS-CoV-2病毒RNA即标记“positive”,空气样本和物品表面样本有一个检测到SARS-CoV-2病毒RNA即标记“suspect”。
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