MPOX（又名。猴痘（MPXV）是一种由猴痘病毒引起的传染病。它会导致疼痛的皮疹、淋巴结肿大和发烧。大多数人完全康复，但有些人会病得很重。任何人都可能患上猴痘。目前，世界多个地区发生了多国猴痘疫情。猴痘病毒感染的确认基于核酸扩增检测 （NAAT），使用实时或常规聚合酶链反应 （PCR） 检测病毒 DNA 的独特序列。PCR可以单独使用，也可以与测序结合使用。

猴痘病毒变异株监测，使用NextGenPCR®文库制备进行纳米孔测序

测序可以跟踪病毒的传播以及可能使病毒更具传染性或危险的任何突变。NextGenPCR测序试剂盒与NextGenPCR设备相结合，可提供超快的纳米孔测序。该试剂盒还可以与其他PCR设备配合使用。NextGenPCR设备已被证明具有超快且非常精确的特点，可为纳米孔测序产生最终质量的扩增子。

对人畜共患猴痘病毒（MPXV）感染进行快速基因组监测可以为了解病毒的地理/人口传播提供有价值的见解，并指导公共卫生干预措施。在当前的MPXV测序方法中，从样品中分离的核苷酸直接在纳米孔测序仪上进行测序。现有方法效率低下，因为它的基因组覆盖率低，目标片段的测序深度低，而且由于样本无法进行多路复用，因此成本高昂。为了帮助实验室进行MPXV基因监测工作，Molecular Biology Systems开发了一种超快文库制备方案，用于分析样本中的MPXV基因组。190kb MPXV 基因组的扩增是通过使用基于 PCR 的 2.5kb 片段（总共 88 个扩增子）的扩增子来实现的。使用NextGenPCR®超快PCR化学试剂，可在42分钟内完成方案的完整PCR循环程序。

该实验设置是一种使用NextGenPCR和Oxford Nanopore技术的组合对猴痘病毒全基因组进行测序的方法。该实验旨在提供猴痘病毒的快速基因组监测，这有助于指导公共卫生干预措施。这实验设置与现有方法相比具有几个优势，例如更快的实验流程时间、更高的灵敏度和更低的成本。该方案还成功应用于对荷兰和美国患者的猴痘病毒基因组进行测序。

爱尔兰都柏林国家病毒参考实验室的高级临床科学家迈克尔·卡尔（Michael Carr）教授进行了一项全国性研究，以阐明猴痘病毒（MPXV）在爱尔兰的进入和传播。他使用的方案利用定制设计的 NextGenPCR® MPXV 引物池（货号 #50025）进行 PCR 平铺，使用户能够扩增完整的 190 kb MPXV 基因组，然后可以进行完整测序。使用下一代测序分析所得扩增子，以准确确定目前在爱尔兰传播的 MPXV 菌株。有了这些数据，卡尔实验室能够为爱尔兰的决策者提供关键信息，以预防未来可能爆发的猴痘疫情。

阅读更多关于他的研究 Multiple Introductions of Mpox virus to Ireland during the 2022 International Outbreak 并参考 NextGenPCR® 产品页面 了解更多信息。

荷兰MBS公司NextGenPCR系统，使用超快速NextGenPCR热循环技术为Oxford Nanopore测序平台提供多种基于PCR的文库制备解决方案。结合NextGenPCR文库准备工作流程，可将实验室的通量提高至400%。

使用NextGenPCR技术进行文库制备的好处：

• 当时间紧迫时，可更快获得测序结果。

• 适用于多重扩增子文库制备。

• 每天最多增加400%的数据量。

• 短基因组模板和长基因组模板的稳健和高精度PCR。

• 直接PCR，无需核酸提取。

   

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