细菌感染是临床上十分常见的感染类型。一般说来，感染性疾病的确诊主要依靠传统的病原学检测，其缺点是检测过程太长，可能会耽误疾病诊治。疑似细菌来源的急性感染需要快速的医学诊断和正确的抗生素治疗。如果症状足够严重，医生通常早于正确诊断之前就选择使用广谱抗生素对患者进行治疗。病原学检测通常需要几周才能得到正确的诊断，并且只能在一部分病例中有明确的诊断。这个过程中，患者得不到准确的治疗，只能等待。更快、更准确的病原诊断方案显得尤为重要。

随着测序技术的发展，16S核糖体RNA（16S rRNA）全基因测序已经成为当前研究微生物群落组成和分布的重要手段。通过16S rRNA基因的测序来鉴定样本中的细菌菌株从而完成感染性疾病的病原学诊断成为可能。

最近Molecular Biology Systems公司推出一个利用超快速NextGenPCR平台和纳米孔三代测序技术相结合，在1天内完成细菌感染病原学诊断的方案，为细菌感染性疾病患者带来了福音。

在本方案的应用简介中，展示了一种新的测序样品制备方法的威力。该方案基于超快速的小于35分钟即可完成16S rRNA全基因文库制备的NextGenPCR基因扩增和随后的实时纳米孔序列分析，在一天的工作流程中产生16S rRNA全基因序列数据。NextGenPCR®扩增方法不需要培养原始样品，因此可以应用于临床和环境研究中进行快速细菌鉴定测试。

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