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NGS文库自动化构建实例
来源: Admin    更新时间: 2016-07-28    浏览: 315 人次


 
空白在二代测序中,基因文库的构建是一项十分耗时耗力的工作,需要熟练的科研技术人员在整个操作过程中保持需高度注意力,花费大量时间和精力才能完成建库工作。因此,大多数实验室有将文库构建工作自动化的需求,以节省人力。
空白应文库构建自动化的需求,派玛.迪格(PrimaDiag)公司研发了ACSIA NGSLibPrep自动建库平台,该平台移液精准,重复性高,使用了创新专利技术APIM(感应磁化吸引技术)处理磁珠,根据需求通电或断电产生磁力和去磁化,温度控制精准到0.1,震荡速度200 - 3000 rpm范围可调。
空白归功于ACSIA平台的灵活性,派玛.迪格公司的科研人员将NEBNext Ultra DNA kit的文库构建操作步骤在ACSIA文库构建平台上实现了全自动化。派玛.迪格公司将提供优化好的预设程序,中途不需要人工干预,一次实现96个文库的全自动化构建。3小时的人手建库工作,使用自动化平台,只需人手操作10分钟。
空白经过优化的操作步骤允许使用最少的枪头数来完成整个建库工作,大大节约试剂和耗材成本。例如构建48DNA文库仅需要3盒枪头,而人工操作使用的枪头数会达到14盒之多。
比较ACSIA全自动化和人工建立的文库,DNA片段大小分别是338 bp  340 bp,十分相近,见图1,而使用ACSIA建库得到文库质量比人工建库高将近30%,见图2
空白减少人手操作时间,极大的节省枪头成本,文库得率显着增加,使得NEBNextUltra DNA kit ACSIA NGSLibPrep自动文库构建平台上完美实现全自动化建库。
 
1:自动化和人工建库得到的DNA片段大小接近
2:自动化和人工建库的到的平均质量
分别是1864 ng 1284 ng
 
 
 
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